包括美国在内的发达国家，农业环境治理经历了从盲目开发、破坏资源到全面治理、恢复生态的过程。20世纪50～60年代，随着越来越多的西方国家将现代科学技术应用到农业生产中，以及集约化程度大幅提升，农业环境水土资源持续恶化，农田流失严重，土壤污染加剧，大量施用农用化学品造成耕地板结、土壤有机质丧失、微生物活性减弱等问题。这个时期，美国和欧洲国家十分重视对农业环境的治理。德国、比利时等国由政府组织建立了相关的农业环境保护协会，注重土壤侵蚀治理，通过停耕、休耕等多种措施，保护土地资源。20世纪70～80年代，农业环境治理步入法制化轨道。这一时期，美国成立国家环境保护署，颁布了一系列环保法规。其中，对于农业环境问题的治理，除继续以前土壤保护政策外，还通过采取新的法律和政策、科技和工程、宣传和教育等措施，来提高公众环保意识和环保能力，改善农业生产的内环境。同时，政府对整个国家的水污染、空气污染、固体废弃物污染等进行的大规模治理，改善了农业生产的外环境。至2019年，这些国家农业环境治理法律体系已基本完善、治理技术先进、项目运行规范，农业生产已走上了可持续发展道路。

随着中国经济20多年来的高速发展，生态破坏和环境污染成为21世纪初中国农业环境的两个突出问题。资源过度消耗，农业投入品大量增加，农业面源污染加重，农业生态系统退化明显，部分区域耕地质量退化问题依然突出。中国政府借鉴世界各国治理农业环境的先进经验，在强化农业环境管理，积极防治工矿企业及农业面源污染，加强农业环境监测网建设，制定有利于农业综合开发的技术经济政策，在开发农业农村环境治理工程等方面也取得了显著效果。中国农业部于2016年底发布的《农业资源与生态环境保护工程规划（2016—2020年）》提出一系列目标，计划到2020年实现农业资源永续利用水平明显提升，农业环境突出问题治理取得积极进展，农业生态功能得到改善和恢复，农业绿色化发展取得重要进展。为此，该规划确定了加强耕地质量建设与保护、推进农业投入品减量使用、开展农业废弃物资源化利用等8项重点任务，即中国农业环境治理的主要任务。

完善和制定农业环境相关法规政策。针对农业环境污染的特点，将农业环境和农业自然资源的保护统一起来，规定农业环境治理的具体措施和内容，建立健全农业环境保护的法律法规体系。同时协调农业、水利、财政、环保等多部门的关系，提高农业环境保护立法的针对性、可操作性和规范性，有力保障农业环境治理的效率。

建立健全农业生态环境管理体系。加强农业环境监测网建设，监督和检查农业环境治理的成效，同时把农业环境的治理技术研究、开发、推广和应用与管理体系相互结合起来。

实施农业环境治理工程。①化肥农药氮磷控源治理。推广测土配方施肥技术，增施有机肥料，推广高效肥和化肥深施、种肥同播等技术；实施平缓型农田氮磷净化；实施农药减量控害，推进病虫害专业化统防统治和绿色防控，推广高效低毒农药和绿色环保新剂型。②推进规模化畜禽养殖场污染减排治理。实施以生态还田、沼气工程为主的减排模式，实现雨污分流、干粪收集处理、尿污水发酵处理，推动规模化畜禽养殖场进行污染减排治理，实现资源化利用，建立健全畜禽养殖场粪污处理设施长效运行管理机制，探索第三方托管运行模式。③加强土壤修复及保育。以中低产田和蔬菜大棚等障碍土壤修复和保育为重点，采用种植绿肥、秸秆还田、有机肥料投入等技术措施，降低土壤总盐量，提高土壤有机质水平。运用化学、生物及物理等现代科学技术手段，修复被农药、重金属及其他污染物污染的土壤。④大力推进农村生活污水和农业面源污染治理，不断提高农业用水水质，确保农业生产安全的用水需要。

实施农业环境综合治理，强化土壤污染管控和修复，加强农业面源污染防治，开展农村人居环境整治行动，对保证农业环境、资源保护的科学协调发展，对农业真正走上可持续发展的轨道具有重要意义；同时，对推动形成人与自然和谐发展现代化建设格局，为保护生态环境，建设美丽地球，使人们过上天蓝水清的生活起到重要作用。

加强农业环境保护资金投入力度。进一步加大对农业环境治理投入力度，加快转变农业发展方式。健全农业可持续发展投入保障体系，推动投资方向由生产领域向生产与生态并重转变，投资重点向推进农业可持续发展倾斜。鼓励引导金融资本、社会资本投向农业资源利用、环境治理和生态保护等领域。

加强农业环境治理科研体系建设。着力加强科研体系建设，满足农业环境治理对科研的需求，加强农业环境治理科技工作的顶层设计，在化学肥料农药减施、高效节水、农田生态、农业废弃物资源化利用、土壤修复等方面推动协同攻关。

强化农业环境治理科研项目的科学化管理。利用大数据软件实施项目管理，依托农业遥感、资源、生产等各类数据，开发适合不同类型项目的实施软件，按照立体、综合的要求设计农业环境治理项目，项目区内实施综合治理，切实增强项目建设实效。