生物功能化的目的是赋予材料特定的生物功能，例如通过化学反应将材料偶联上抗体，即赋予其识别相应抗原的功能，用于抗原检测。根据需要，将材料偶联上具有不同生物功能的分子，即可用于相应的生物传感、生物富集与分离、生物催化等方面。如果材料本身具有示踪性能，则在经过偶联具有生物识别功能分子的生物功能化后，即可构建出的功能体，即为生物探针。在这种特定情况下，“生物功能化”和“生物标记”的本质是一样的，只是定义的角度是相对的（见生物标记）。但除此之外的情况，这两个概念是不能互通的。

生物功能化需要特别注意的是，所采用的方法应该温和、高效、可控。

生物功能化方法广泛应用于生物传感器、生物芯片、生物探针、生物富集与分离、生物反应器、生物燃料电池等各个方面。