扶余建国于何时，史家考订，尚无定说。西汉已有扶余，称王于濊地，故有“濊王之印”，有故城名叫濊城。

汉代扶余，在长城以北，去玄菟千里；南与高句丽、东与挹娄、西与鲜卑接，北有弱水，地方可二千里，户8万，于东北各族中，地最平敞，农业发达也最早。过去，治史者多以为扶余以今吉林省农安为中心。近年来，考古学与历史地理学的发展，有的学者认为早期扶余王城应在今吉林省吉林市区，高句丽强大以后，扶余王城才西迁至今农安县境内。其范围，相当于今西以农安为中心，东以吉林市为中心，四平以北，哈尔滨以南，东北平原中部。自汉以来，役属挹娄，使其不得自通贡于中原；至三国时，高句丽渐强，而扶余衰弱，挹娄始自通贡于中原。

扶余物产丰富，除五谷之外，又出名马、赤玉、貂豽、大珠，以金银为饰。其王以六畜名官，有牛加、马加、猪加、大使等号。围栅作城，有宫室、仓库、牢狱。邑落有豪民，名下户皆为奴婢。其法严苛，男女淫皆杀之。杀人偿命，尽没其家人为奴婢。其俗，用殷正月祭天，遇战亦祭天，杀牛，以蹄占凶吉。死则有椁无棺。厚葬，富者杀人殉葬，多者以百数。兄死妻嫂。

西汉时，扶余于濊貊各族中为最强，属汉玄菟郡。扶余王死，至玄菟郡取玉匣（金镂玉衣）以葬，说明享有汉诸侯王葬礼。东汉自建武二十五年（49），扶余王朝汉，终汉世不绝。东汉末年，高句丽围攻汉朝玄菟郡，扶余王派其子尉仇台率兵2万余助汉破高句丽。后来，因鲜卑、高句丽强盛，扶余正处于两大族之间，逐渐衰弱。至晋太康六年（285），为鲜卑慕容廆（269～333）击破，国王依虑自杀；不久，在晋朝的支持下，依虑之子依罗因得复国。晋永和二年（346），慕容皝以其子慕容儁统军，又大败扶余。经过这两次打击，扶余大衰。至北魏太和七年（483），灭于勿吉，其王投奔于高句丽。太和十七年（493）扶余王室之残留故地者，复被勿吉所逐，遂北渡那水（嫩江及东流松花江），徙居今嫩江支流富裕尔河一带，金代蒲与路治在富裕尔河沿岸并以此河得名，都因扶余遗裔居于此河流域，是扶余的对音。

高句丽和百济王室均出自扶余，所以高句丽、百济都曾冠以扶余之号。一说，扶余建国之前，北方有稾离，亦称橐离，或称索离，其王有婢，感气而生子名东明，南下至濊地建国称扶余，因而古稾离即北扶余。