施肥诊断直接观察作物对被怀疑元素的反应，结果可靠，也用于诊断结果的检验。分为根外施肥诊断法和土壤施肥诊断法。

将拟试元素肥料以根外施肥即叶面喷洒涂布、叶脉浸渍注射等方法供给作物，进行检验。此法在果树微量元素缺乏的诊断上应用较多，有吸收见效快、用料少、经济省事等优点。同时，供试液不与土壤接触，避免土壤干扰，对易被土壤吸收固定的元素，如铁、锰、锌等尤为适宜。

具体方法有：①自动吸收和注射法。叶片、叶柄、小枝、嫩枝或茎都可作为处理部位，原则是选取已完成生长但仍具有活性的部位，可先用1%复红或次甲基蓝水溶液进行试验（注入选定组织或在切口上涂抹），如药液在组织中分布不匀或很少移动表示已无活性，应另行选择。确定处理部位后，用下述方法处理：一法，叶片导入。在选定叶片的背面靠近主脉的某一支脉，用刀片横向做一切口，不能切穿，用棉球浸蘸供试液置于其上。二法，叶柄导入。切除叶肉，留叶柄，将其插入盛有供试液的小试管中，然后用棉花塞好，再用石蜡封口，并将小试管用胶布（纸）等固定于小枝上。三法，对树木可在枝条上用小钻孔器钻孔，深达输导组织，然后用注射器向孔内注入供试液，堵塞小孔以防流出，也可用固体试药混拌锯木屑等填料塞入，以石蜡封塞。②喷雾和涂抹法。将供试液喷洒或用毛笔、脱脂棉蘸吸溶液涂布于患病叶片上，使其吸收，若叶片角质层较厚，应添加0.1%～0.3%的中性皂或洗衣粉以增加黏附性。

根据对作物形态症状的初步判断，设置被怀疑的一种或几种主要导致症状形成的元素肥料作处理，把肥料施于作物根际土壤，以不施为对照，观察作物反应作出判断。除易被土壤固定而不易见效的元素如铁之外，大部分元素都适用。注意所用肥料需是水溶速效的，兑水近根浇施，以促其尽快吸收。在水稻上可采用简易穴施试验，方便可靠，用拟试元素肥料与被测田的土壤混拌，制成球肥塞于水稻根际，以邻近植株为对照，观察反应作出判断。如为探测土壤可能缺乏某种或几种元素，可采用抽减试验；根据需要检测的元素，在施完全肥料（氮、磷、钾加拟试元素肥料）处理基础上，设置不加（即抽减）待测元素的处理；如同时检测几种元素则设置相应数量的处理，再加一个不施任何肥料的空白处理，其试验处理数是n（需要检测元素数）+2，结果以不施某元素处理与施完全肥料处理比较，减产达显著水准，表明缺乏，减产程度可说明缺乏程度。上述各种试验也可采用盆栽进行，但由于盆栽与田间条件有许多差异，如土层厚度、土体结构、温度、湿度以及受灾害性天气影响等，一般盆栽不利于缺乏症的发生。施肥诊断一般需要较长时期，其结果通常只能应用于下季作物。