原囊菌属为子囊菌真菌，营养体发达，产生不规则分枝状有隔双倍菌丝体，无性繁殖产生厚壁的休眠细胞-厚垣孢子。是在寄主体内由菌丝顶端或中间膨大而形成。有性生殖产生子囊，子囊由厚垣孢子萌发而来，其内有子囊孢子。厚垣孢子侵染寄主植物表皮或深层细胞，经过长时间的休眠后萌发，病菌最初从植物茎的下端侵染，初期在植物茎部产生光滑小瘤，后期逐渐变得粗糙并破裂；随后向上延伸侵染叶，植物叶皮质化；最终侵染花和果实，使果实过度肿大、变长，降低产量和品质。

原囊菌属主要寄生在伞形花科如羊角芹、峨参、当归、胡萝卜、芫荽和一些菊科植物的茎、叶、花和果实上，引起瘤状肿大。也有一些茎瘤病为非侵染性病害，也叫生理性病害，如青花菜茎瘤，主要发生在西兰花营养生长中、后期至花球采收前，田间症状表现为近土表处花茎基部出现突起，以后不断膨大，逐渐形成一个环状的小球形瘤状体或数个大小不一形似菠萝表面的球状瘤，茎横切后可见有无数条放射线伸向球体内部，中间变为褐色木质化的硬心，严重时腐烂、发臭。

此病的发生与地势、土质、肥料、气象条件、栽培管理措施、排灌及喷药等诸多因子有关。一般地势低洼、雨水较多、施用未充分腐熟土杂肥的田块发病较重。