栖居在土壤中的活的有机体，一般分为土壤微生物和土壤动物两大类，另外也包括高等植物生活在土壤中的根系。土壤生物种类众多、数量巨大，蕴含着丰富的功能基因，进行着复杂的代谢过程，支撑着多样的土壤功能。除参与岩石的风化和土壤形成与发育外，其对土壤肥力演变、土壤结构改善、土壤健康维护、土壤环境保护以及植物营养供应等均有重要作用。土壤生物是生物地球化学循环的执行者，通过代谢以及生物间的相互作用推动碳、氮、磷、硫、氢、氧等化学元素在生命体和非生命体之间的迁移和转化。

土壤生物的生命活动在很大程度上取决于土壤的物理性质和化学性质，包括温度、湿度、通气状况和气体组成以及pH、有机质与矿物质的数量和组成等。此外，耕作、栽培、施肥、灌溉、排水和施用农药等农业技术措施也会影响土壤生物的生命活动。由于土壤的复杂性，对土壤生物的组成及其在土壤中的很多功能和相互作用还认识不足。在一定条件下，可通过接种等措施有目的地提高某种生物的数量及其生化强度。