孔隙是土壤的本质特性，没有孔隙的土壤是岩石。生物通过孔隙进入土壤，同时生物能够促进孔隙的形成、变化。土壤中孔隙网络结构影响水分的入渗和保存、气体的进入和释放以及化学物质的运输和交换。

一定体积土体内孔隙所占的空间可以用孔隙度来表示，又称土壤总孔隙度。土壤由固、液、气三相物质组成，它们所占的体积为V_s、V_l和V_g。所以土壤的总体积V=V_s+V_l+V_g。那么此土壤的孔隙度ϕ=V_l+V_g/V=（1-V_s）/V。如果已知土壤的质量m_s，土壤容重ρ_b=m_s/V。孔隙度ϕ=（1-V_s）·ρ_b/m_s，土壤颗粒密度ρ_s=m_s/V_s。所以孔隙度ϕ=1-ρ_b/ρ_s。

按照孔径大小可以将土壤孔隙进行分类，在不同的研究中存在一定的差异。一般分为大孔隙（＞75微米）、中孔隙（30～75微米）、微孔隙（5～30微米）、超微孔隙（0.1～5微米）和隐孔隙（＜0.1微米）。通过孔径对土壤孔隙进行分类会忽略孔隙间连续性、弯曲性和连通性，从而无法将土壤孔隙的孔径与其功能联系在一起。在研究土壤孔隙和水分运输关系的工作中，将土壤孔隙分为结构孔隙和质地孔隙，考虑不同孔径大小的孔隙在土壤水分运动中的作用。结构孔隙指微团聚体之间的孔隙，质地孔隙为初级土壤颗粒间的孔隙。