位于新疆维吾尔自治区阿克陶县境内,西昆仑山脉西端的山脊线上。呈西北—东南走向,海拔7719米。是昆仑山脉主峰,与其直线相距仅15千米的公格尔九别峰(海拔7595米,西昆仑山脉第二高峰),以及它们南面的慕士塔格峰同居西昆仑山脉,并称为东帕米尔高原上的三大高峰。山峰呈金字塔形,几乎全由岩石和冰雪构成,岩石主要是层状变质岩。
地处内陆深处,气候十分干燥,天气变化频繁,即使在夏季,山上也会风雪交加,气温可下降到-20℃。降水主要来自高空西风带气流和极地冷湿气流的相互作用。在海拔7500米左右,平均气温-20℃,最低可达-30℃;最大风力9~11级,通常风力7级左右。
公格尔山山势险峻,海拔一般在7000米以上,现代雪线约5900米,因而冰川规模与冰川地貌发育较好(见图)。克拉牙依克拉冰川发育在公格尔山的北坡,面积128.15平方千米;其木干冰川发育在公格尔山的东坡,面积103.17平方千米。山体冰雪厚度可达百米,冰峰雪坡弯曲错落,明暗裂缝丛生。悬垂冰川吊卧在山体上部,似乎随时有崩塌的可能。山坡浮雪深厚,峰体平均坡度约45。,雪崩频繁;有高差达300米左右的雪崩区,小规模雪崩随时可见,大规模雪崩也时常发生。1983年5月末发生5.5级地震,引发落差达1000~2000米的罕见雪崩。