生物浸矿直接作用模型如图所示。微生物首先吸附在矿物表面，然后依靠硫化物、由硫化物氧化产生的矿物金属阳离子（如二价铁离子）以及硫元素的氧化来获得代谢生长的能量；而氧化释放的电子经过呼吸链，通过细胞壁到达细胞质膜，与微生物呼吸作用的氧相结合。

生物浸矿直接作用模型

关于微生物吸附到矿物表面的作用方式，主要有2种观点：一种认为是化学吸附方式，另一种则认为是物理吸附方式。前一种观点认为，在微生物浸矿过程中微生物可能通过一层未知黏膜黏附在矿物表面，这种黏膜可能是某种蛋白质，微生物是通过氢键、离子键、化学键或蛋白酶与矿物表面进行作用的。后一种观点认为静电力是微生物在矿物表面吸附的有效途径，微生物的吸附对硫化矿表面电性有较大影响。

微生物对硫化矿浸出的直接作用可表示为：

其中M为Cu、Zn、Pb、Co、Ni等金属。

黄铜矿和黄铁矿的反应为：