群落中各种不同的微生物种群能以有规律的方式共处，同时它们具有各自明显的营养和代谢类型。

冶金微生物群落可以反映极端酸性冶金环境条件下的微生物物种组成，各种微生物物种的数量及物种相互之间的比例关系，反映冶金过程中微生物种群结构的动态变化过程。了解冶金过程中微生物间的相互作用，有助于发现对冶金过程的金属溶出起关键作用的物种，便于生物冶金机理的分析和生物冶金过程的优化。冶金微生物群落分析还可反映冶金微生物向周边环境的迁移情况及环境微生物向生物冶金体系的迁移情况，有助于了解生物冶金堆浸场和周边环境之间的相互影响。

20世纪70年代以前，对冶金微生物群落结构及多样性的认识依赖传统的微生物分离培养的方法，但由于很多冶金微生物是相对难以培养的，故当时对微生物群落的认识是不全面的。70～80年代，在微生物化学成分分析的基础上建立了生物标记物方法，对微生物群落结构和多样性的认识进入到较客观的层次上，但这些方法的分辨率相对较低，准确性不高。80～90年代，以DNA为目标物的现代分子生物学技术比较精确地揭示了微生物的种类和遗传多样性，并给出了关于群落结构的直观信息。21世纪以来，第二代高通量测序技术具有低成本、高通量、流程自动化的优势，日趋成熟和普及，为微生物群落结构研究提供了新的技术平台。