中国农业部、国家林业局与福建省政府共建。校址位于福建省福州市。学校前身分别为创办于1936年的福建协和大学农科和创办于1940年的福建省立农学院。2000年，由原福建农业大学和原福建林学院合并组成。

学校设有作物科学、植物保护、园艺、林学、生命科学、动物科学、蜂学、资源与环境、食品科学、材料工程、计算机与信息学院、机电工程、交通与土木工程、管理、旅游、经济学、公共管理、文法、马克思主义、艺术、园林等学院。设有国家重点实验室1个（闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室）、国家工程技术研究中心2个、国家地方联合工程实验室（工程研究中心）2个。

截至2018年，学校有教职工2700多人。有全日制在校生2.7万人，其中博、硕士研究生5000余人。校园占地320余公顷，另有科教基地78.5公顷，教学林场3060公顷。

学校有1个国家重点学科（植物病理学）、1个国家重点培育学科（作物遗传育种）、2个农业农村部重点学科、7个国家林业和草原局重点学科，9个福建省特色重点学科、21个福建省重点学科和3个省级优势学科平台。学校有11个一级学科博士点，25个一级学科硕士点，10个硕士专业学位授权点。学校是教育部中国政府奖学金留学生接收院校，与南非德班理工大学合作共建全球第二所农业特色孔子学院；与美国德州农工大学联合培养博硕士研究生项目。

该校学者在全球率先破译小菜蛾基因组、菠萝基因组、香荚兰基因组，相关成果发表在《自然》（Nature）、《科学》（Science）、《细胞》（Cell）等国际权威期刊上。学校发明的菌草技术推广到101个国家；育成的甘蔗品种占全国甘蔗种植面积的85%；育成的麻类品种占全国的2/3并覆盖全国种植面积1/2以上；选育了全国推广范围最广的甘薯和花生新品种。获得国家科学技术三大奖32项。

学校正全面推进高水平大学建设，朝着建设更具特色更为开放更加和谐的中国一流农林院校的奋斗目标阔步迈进。