烟叶贮藏的目的一是降低损耗，调节供需平衡，保证产品质量稳定，保证均衡生产；二是通过自然发酵，使烟叶外观、内在品质有明显改善，以提高烟叶的经济价值。

堆放烟叶的地点要求密闭、干燥、不通风、不受阳光直接照射、不受外界温湿度变化的直接影响。由于初烤烟在堆放时容易吸收外界湿气而回潮、失去水分而干燥、阳光直射而褪色、吸收异味而污染，所以选择的烟叶堆放地点除达到上述要求外，还应远离化肥、农药等有异味的物质。堆烟室的地面要铺木板并架空，距地面40厘米以上，木板上铺稻草或麦草，再铺塑料布，然后堆烟。初烤烟保存一般以堆垛形式进行，烟垛的大小—般是高宽各1.5米左右，长度根据堆放烟叶的房间而定，也可以用圆形装烟袋作柱状保存。烟垛应离开墙壁20～30厘米，以免湿气渗透浸入。烟叶堆放时，应叶尖向里，叶柄向外，层层叠放整齐。为方便以后分级，防止部位混淆，还应按炉次把不同部位、不同质量的烟叶分开堆放，特别是青黄烟、微带青烟应单独堆放，并保持一定的温湿度，以利于青烟在堆放过程中变化。堆垛完毕后用塑料布包盖严密，上面再盖以麻片或草席等物遮光，以防止烟叶褪色。

业内普遍认为烟叶贮藏过程中的发酵机理主要包括酶作用、微生物作用和氧化还原作用等。

酶是生物体内普遍存在的一种具有催化活性的蛋白质，具有一般蛋白质的结构特征和物理性质，是生物体内的催化剂，脱离活细胞仍保持一定活性，但不能在生物体外合成。新鲜烟叶采收后，细胞内存在许多酶，虽然经过调制会有一部分损失，但仍有部分残留。在烟叶原料加工过程中，这些酶会促进和产生一系列生理生化反应，从烟叶调制、干燥、贮存到醇化，都有其作用。

烟叶在调制前后，表面都存在一些微生物。它们在生长繁殖过程中可产生和分泌多种酶类，以分解和利用生长基质。在环境条件适宜时，微生物开始生长繁殖，并对烟叶内在品质产生影响。一般认为微生物也是促使烟叶醇化的原动力之一。

在醇化过程中，烟叶从空气中吸收氧气，放出二氧化碳，这是醇化过程及特征的主要标志。烟叶经常产生的自热现象也与焦糖化反应和氧化还原作用有关。

主要使用仓库除湿机、库房温度控制设备。

一般贮藏时间为2～3年。应对烟叶进行分类，以便于纯化烟叶质量和分级解烟时按烤次的先后对部位分类。黄烟和青烟应分开堆放，因青烟存放时间较长，以减少含青度，有利于提高品质和等级；而黄烟则不宜贮存过久，否则光泽变差。

随着现代烟草农业建设的推进，新烟区不断开发，对作为重要配套设施的初烤烟叶仓库设施应给予充分重视，在资金投入方面加大力度。烟草公司可以对原有仓库进行升级改造，扩大仓库容量，完善仓库防潮、隔热、通风、密闭、排湿等功能。