网站组织的站点包括由源信息组织而来的一次站点，如企业自行建立的信息发布站点；还包括通过对网上已有信息的收集，从而重新进行二次组织形成的站点，如导航站点、学科门户站点等。网站通过主页和超链接方式将相关的页面关联组织起来，它不是众多网页的简单链接，为了使网站具有良好的用户可用性，必须对网站所关联的页面进行组织和架构，提供良好的导航服务和检索服务。网站的主要实现手段就是进行网页制作，但除了这些以外，它还应包括对整个站点的内容的规划、模块的划分以及技术的实现等内容。网站组织比网页制作要复杂得多，可以把它看作一个大而复杂的超文本系统。网站建设的过程就是进行超文本系统开发的过程，需要对收集到的信息或者原始的素材进行超文本的分析，然后进行系统的建模和实现。

网站信息组织主要通过分类信息组织方式，将信息资源按照某事物事先确定的概念体系结构，分门别类地逐层加以组织。用户通过浏览的方式逐层加以选择，层层遍历，直到找到所需的信息线索，并通过信息线索直接找到相应的网络信息资源。分类信息组织方式为网站中应用较广泛的信息组织方式。在网站核心信息的确定及管理过程中，网站所包含的信息不可能面面俱到、包罗万象，网站信息组织应具有突出的特色，应面向特定的用户，明确他们的需求。网站设计要有目的性，在收集、整理信息时始终要突出企业的核心业务。