不同晶格能差相对较小的不同晶体容易发生转型，稳定性差。

对于物质的晶型稳定性，在药物制备过程中，由于工艺条件的变化和辅料的应用，会直接影响药物晶型稳定性，所以优势药物晶型的稳定性指在复杂条件下的综合稳定性。

药物多晶型按稳定性，主要分为稳定型、亚稳型和不稳定型。稳定型熵值小、熔点高、化学稳定性好，但溶解度和溶出速率低、生物利用度一般较差。不稳定型则相反。亚稳型则在两者之间，贮存过久会向稳定型转变。

药物晶型稳定性与不同晶型之间的晶格差具有一定的联系。固体药物大多是分子晶体，其晶格能差较小，容易发生转型，稳定性差。在药物样品或制剂的生产制备过程中，许多因素会影响到样品晶型的转变。从不同溶剂中重结晶是获得多晶型样品及晶型转化的最主要方法，如尼莫地平、法莫替丁、棉酚等。研磨也可以使多晶型药物发生晶型转变。研究人员通过对30种多晶型药物进行研磨实验，发现其中11种药物发生晶型转变，其中包括甾体类、磺胺类和水杨酸类药物。环境温度改变导致固体药物分子的晶格能量变化，也可发生晶型转变现象，如甲氧氯普胺、氯霉素和巯基嘌呤等。湿度变化则会使药物样品失去或得到结晶水而发生转晶现象，如咖啡因Ⅰ型和Ⅱ型样品吸潮后，会缓慢转变成水合物晶型。另外，压片、熔融、升华、混悬及加入痕量金属和辅料等方法也都可以引起晶型转变。固体多晶型药物间的晶型转换有时有利，有时则不然，应采取有效的控制措施对多晶型药物样品进行晶型控制，以期达到向药物有效晶型的方向转化。