生于墨西哥城。1980年，从事音乐电台工作，其间曾为多部墨西哥电影谱曲。1990年，开始从事广告拍摄，并尝试向导演转型。2000年，拍摄了处女作电影《爱情是狗娘》，获第53届法国戛纳国际电影节影评人周单元大奖、年轻评论家奖最佳长片奖，第13届日本东京国际电影节东京电影节大奖、最佳导演奖。同年，拍摄动作短片《火药桶》。2002年，与其他11位导演共同拍摄纪录片《九一一事件簿》，获第59届意大利威尼斯国际电影节联合国教科文组织奖。2003年，导演爱情犯罪电影《21克》。2005年，制片《九条命》。

2006年，导演剧情片《通天塔》，获第59届法国戛纳国际电影节最佳导演奖、第79届美国电影奥斯卡奖最佳原创配乐奖、第41届法国电影凯撒奖最佳外国电影奖、第72届美国电影金球奖最佳编剧奖。2010年，导演电影《美错》。2014年，导演影片《鸟人》，获第87届美国电影奥斯卡奖最佳影片奖、最佳导演奖、最佳原创剧本奖，第72届美国电影金球奖最佳编剧奖。2015年，导演电影《荒野猎人》，获第88届美国电影奥斯卡奖最佳导演奖，第73届美国电影金球奖最佳导演奖，第69届英国电影学院奖最佳影片奖、最佳导演奖。2017年，拍摄短片《血肉与黄沙》。

伊纳里图是一位具有开拓与革新精神的导演，电影风格独特，手法新颖。他不断探索新的影像表达方式，如多线索叙事、一镜到底拍摄等。他参与制片的影片有《阿粗和阿呆》（2008）、《母与子》（2009）、《最后一个猫王》（2012）、《沉寂的土地》（2014）。