连作障碍在草莓、葡萄、桃、李、梨、柑橘、樱桃、核桃等果树上均有发生。许多果树在前作为同种果树时发生连作障碍，如桃树连作，幼树表现生长停滞或衰弱，叶片失绿，枝干出现流胶，产量低；梨树在培育过两年苹果苗的圃地上连作，其生长量明显减弱。

产生连作障碍的原因有多种：①植物自毒物质的积累。很多果树具有通过向环境排除化学物质，对同种或另一种果树造成直接或间接生长抑制的功能，是一种自然生存的竞争手段。例如桃的种子、叶、梢、根中含有α-扁桃腈葡萄糖苷，尤以根皮内含量高，它分解时可产生氢氰酸和苯甲醛，这两种物质均可抑制桃根尖的呼吸，使分生组织细胞坏死，对苹果、桃的幼苗生长都可产生抑制作用，而排水不良的园地和黏重的土壤上氢氰酸发生的量多，连作障碍更为严重。粗柠檬的根可产生类香草酸，它能抑制柑橘根的生长，使其先端异常膨大。②土壤理化性质的变化。同类果树根系在土壤中吸收的营养成分基本相同，连续种植同一果树会形成土壤养分失衡，pH和有机质含量发生变化，土壤理化性质遭到破坏。表现为容重变大，通气孔隙比例下降，土壤酸化，易导致细根减少及根系分布上移，严重影响到植株正常的生长发育。③土壤微生物群落结构失衡。由于土壤理化性质改变，使一些有益微生物（硝化菌等）生长受到抑制，而土传病害菌数量增多，导致细菌型高肥力土壤向真菌型低肥力土壤转变，同时线虫和病原物的数量都有所增加。葡萄、桃和柿子都有线虫病，寄生于植物的根系和地下茎中。有些线虫与病菌共同对果树进行危害，为病菌的进入创造条件。而且线虫也是植物病毒的传播媒介体。连作时，大量线虫危害后作果树根系，导致地上部生长衰弱，对土壤中有害微生物变得敏感，如易感染镰刀菌而使根系腐烂等。

不同树种连作呈现的连作障碍强弱不同。日本平野（1966）提出以连作障碍（忌地）系数表示。

同一果树在不同的前作果树下受抑制的顺序见表。如种植桃树时，前作为苹果、枇杷、无花果、葡萄的果园均能对桃树生长产生不同程度的抑制作用，应予以避免。总体来说，无花果、桃、苹果、核桃的连作障碍最为严重，连作时生长量表现为最小1；葡萄次之；而梨、柑橘、枇杷抗性稍强，但生长量也仅为3。

治理果树连作障碍须因地制宜，采取综合措施：①农艺措施。如合理轮作、间套作以及加强土肥水管理等。为避免连作障碍，老果园更新或苗木出圃后，应尽量消除果树或果苗的残根。最好是种两年以上一、二年生农作物。轮作期间，注意促进土壤排水、通气状况和培肥土壤，然后再重建果园和苗圃。如须立即在原地建立果园，应先进行深耕、整地、清除残根，尽量避免在原栽果树的位置挖定植穴，并在新定植穴内换土。如果不能换土，则必须进行土壤消毒。常采用土壤消毒剂福尔马林、氯化苦、1,3-二氯丙烯等熏蒸土壤，或采用太阳辐射和蒸汽等不对环境造成污染的物理措施。②生物防治。通过引入拮抗菌、接种有益微生物和栽植拮抗植物等方式改善连作土壤的性状，在苹果、葡萄、草莓等果树上均有应用。如再植苹果幼树与葱属植物混作能显著促进二年生苹果幼树的生长，显著改善连作土壤真菌群落结构，降低病原菌的数量，特别是尖孢镰孢菌、层出镰孢菌、腐皮镰孢菌和串珠镰孢菌的数量，同时也避免了长期的轮作时间。③选用脱毒苗或抗性强砧木，可以提高果树对环境的适应性，增强果树对病虫害的抵御能力。例如以甘肃桃作桃的砧木，枳作柑橘砧木，均能提高植株抗根线虫的能力；以河岸葡萄作葡萄砧木，能提高植株抗根瘤蚜的能力；在研究再植桃时发现，无论土壤消毒与否，以GF667作为桃砧木时，树体生长发育最佳，产量也高。