北起淮阴市淮阴船闸，南至扬州市邗江区六圩汇入长江，全长169千米。史称邗沟，是京杭运河最早修建的一段。现在里运河仍是煤炭等大宗物资南运的重要通道，航道标准也较高，可通航2000吨级船舶，是整个京杭大运河中等级最高的部分。沿线船闸有淮阴闸、淮安闸、邵伯闸等。1959年，为满足航运，京杭大运河被裁弯取直，留在淮安城区的一段终于卸下“水运”之职，成为一条内城河，即如今的里运河。20世纪70年代开始，里运河疏浚、开发力度没能跟上城市发展步伐，逐渐成为接纳淮安城区污水的排污河，破船、杂物壅塞河道，违章搭建林立河岸。2001年，里运河大规模整治序幕拉开，沿线100多座码头被拆除，沿岸数万平方米的低矮建筑被搬迁，河道内淤泥、废弃船舶全部被清理，大河轮廓重新展现。15万吨、10万吨污水处理厂相继建成使用，2006年里运河主城区污水全线截流。