位于波兰克拉科夫市内。由分布在全市的17个分支机构组成，包括科鲁兹托夫宫、克拉科夫地下中心广场博物馆、奥斯卡·辛德勒工厂博物馆、老犹太教堂、老鹰药房博物馆、盖世太保监狱、市政厅塔楼、城市防御墙、普拉斯佐集中营遗址、兹维日涅茨之家等。主馆位于科鲁兹托夫宫内，通过多点文化遗产地的展示，全方位呈现克拉科夫城市历史。

主馆科鲁兹托夫宫为小型巴洛克风格建筑，位于克拉科夫市中心广场内，于1640～1649年建造，以中世纪住所的守护神圣克鲁兹托夫的名字命名。博物馆收藏了16～20世纪的城市地图、绘画、版画、照片、各行业物品、当地艺术家及工匠作品、贵族肖像、钟表、14～20世纪的武器、犹太文物、战时武器等，常设当地历史与文化展。

地下中心广场博物馆占地约4000平方米，通过地下遗址的考古发掘展示中世纪城市建筑遗迹。常设展览“追寻克拉科夫欧洲身份的痕迹”展出了反映贸易与文化交流的14世纪的硬币、装饰品、陶器，以及中世纪克拉科夫人的日常生活物件。不仅勾勒出城市历史，还展示了这座城市与中世纪欧洲主要贸易和文化中心之间的联系。

老鹰药房博物馆位于旧犹太居住区，为纪念克拉科夫犹太人大屠杀及药师T.潘基耶维茨在此期间救治犹太人的义举而建。常设展览“塔德乌什·潘基耶维茨在克拉科夫贫民窟的药房”据其传记进行讲述，展示德国占领期间犹太聚居区的生活。

老犹太教堂常设宗教主题展览“克拉科夫犹太人的历史与文化”。