样方法主要适用于小型动物调查与监测，具体适用物种见《陆生野生动物及其栖息地调查技术规程 第1部分：导则》（GB/T 37364.1）。

样方监测的程序包括：根据要求布设样方，调查人员到达样方后记录样方位置，进行样方调查，仔细搜索并记录发现的动物名称、数量、影像等信息。外业结束后，根据各样方上记录的野生动物种类、数量等信息，确定野生动物种群密度，也可同时根据各样方的历史记录确定种群趋势。在对较大的样方进行监测时，应至少4人同时从样方四边向样方中心搜索行进，以免漏记从某一边逃离的动物。

样方大小应根据监测对象确定，但对于同一个监测项目，同一种类野生动物的监测样方大小应一致。在进行样方监测时，应有足够的监测人员进行观察，并对样方进行仔细搜索，确保样方内所有的监测对象都能被发现。

在全国第二次陆生野生动物资源调查中，使用样方法对两栖动物及爬行动物进行了调查。根据《全国第二次陆生野生动物资源调查技术规程》，应在爬行动物栖息地随机布设50米×100米的样方，仔细搜索并记录发现的动物名称、数量、影像等信息。非溪流型两栖动物调查宜使用样方法，调查时，应首先确定两栖动物的栖息地，在栖息地上随机布设8米×8米的样方。至少4人同时从样方四边向样方中心行进，仔细搜索并记录发现的动物名称、数量、影像等，调查时仅对两栖动物的成体进行计数。