1996年国务院正式批准保护中国援助柬埔寨吴哥古迹项目立项。1997年，选定周萨神庙作为保护修复的对象，由中国文物研究所（现中国文化遗产研究院前身）承担设计和施工。1998年2月开始现场勘察和工程前期准备工作，2000年3月周萨神庙保护工程正式开工。2007年6月完工，2008年12月，中国政府同柬埔寨王国政府举行项目竣工交接仪式。

周萨神庙始建于公元12世纪上半叶，是吴哥建筑艺术成熟期的一座中小型建筑，位于吴哥王城胜利门外约500米处。周萨神庙坐西朝东，东西长220米，南北宽38米，由九座主要单体建筑组成：四座楼门、两座藏经殿、中央圣殿、高架甬道和东神坛。除西楼门在20世纪初由法国远东学院维修外，其余八座建筑均损坏严重，其中两座藏经殿和北楼门仅有基座尚存，寺庙周边散落着5000余块坍塌下来的石质建筑构件。周萨神庙保护工程分为三个阶段进行，第一阶段包括东神坛、高架甬道和南藏经殿三个项目；第二阶段包括南门、东门两个项目；第三阶段包括北门、北藏经殿、中央圣殿三个项目及环境整治工程。工程对周萨神庙全部建筑进行了整体保护性修缮，绝大部分散落构件被归安复位。中国的文物保护理念、技术措施获得国际层面的检验和认可。

周萨神庙保护工程是中国第一个大型文物保护援外工程项目，为中国文物保护工作者参与国际文化遗产保护积累了丰富的实践经验，充分体现了中国作为一个负责任的文物大国积极承担国际义务的形象。