重庆云阳县张飞庙又名张桓侯庙，原址位于三峡库区175米的淹没线以下，经国家文物局批准，对张飞庙的地面建筑进行整体搬迁。新址选在与原址相距32千米处的云阳县新县城对岸的盘石镇龙安村狮子岩下。1996年，三峡工程库区文物保护规划组将张飞庙确定为重点保护项目，实行单项规划，专题论证，并委托清华大学制定了张飞庙整体搬迁保护规划。2001年8月，张飞庙搬迁方案获国家文物局批准，由北京市大龙建设集团、湖北大冶殷祖园林古建公司负责实施。2002年10月开工，2003年7月竣工，获国家文物局专家组验收通过后，于2003年7月19日正式对外开放。

拆迁以主体建筑为先，其顺序为杜鹃亭、前后出师表陈列室、助风阁、望云轩，最后为正殿、戏台和结义楼合成的院落。拆迁过程中对原构件中的砖、瓦、石、木，逐一编号记录，对木制构件进行防腐、防虫、防火处理。

张飞庙搬迁保护工程是三峡文物保护中规模最大的搬迁保护工程，在选址上，选择在与原址环境相近的环貌。在整体布局上，营造了与原张飞庙相似的外部环境。在搬迁中，将原建筑构件进行编号，再以传统的工艺方法和手段，按照编号的顺序原样复原，使原有的古代元素和建筑风格得到了最大程度的保留，遵循了完整性与真实性的文物保护原则，最大程度的保留了原有文物的环境与建筑风格。