由中国文物研究所（今中国文化遗产研究院）与中国建筑设计研究院历史研究所合作完成。2001年开始规划，2004年4月完成并通过国务院相关部委审查和国家文物局批复。

规划根据吐鲁番地区遗存的特点和保护、利用需求，科学划定了各遗存的保护范围和建设控制地带，提出了管理要求；根据遗存残损情况和隐患，提出了保护对策；根据利用需求，提出了科学合理的旅游线路设置，并对相关服务、展示设施提出了要求。同时，规划协调了文物保护与区域农业生产及经济发展之间的问题。该规划为后来文物保护规划理论的构建及编制工作的制度化和常态化进行了有益探索，并获得了2014年度建设部华夏建筑设计一等奖。