水产饲料加工包括配合饲料、浓缩饲料、添加剂预混合饲料的加工。水产配合饲料的物理形态主要有硬颗粒饲料、破碎颗粒饲料、挤压膨化饲料和少部分粉状饲料产品。水产浓缩饲料和添加剂预混合饲料产品主要是粉状料。

水产硬颗粒配合饲料的加工工艺过程主要包括原料清理、微粉碎、超微粉碎、配料、混合、调质、制粒（环模或平模制粒机）、后熟化（对虾硬颗粒料用）、冷却、破碎（根据需要选用）、筛分、液体喷涂（可选）、成品包装等。水产膨化饲料的加工工艺主要包括原料清理、微粉碎、超微粉碎、配料、混合、调质、挤压膨化（单螺杆或双螺杆挤压膨化机）、干燥、液体喷涂、筛分和包装等。而粉状配合饲料、浓缩饲料、添加剂预混料的加工过程主要包括原料清理、微粉碎、超微粉碎、配料、混合、成品包装等。

饲料的质量控制主要包括原料和添加剂的进厂质量控制，储存运输中的质量控制、加工过程、饲料检化验过程及成品包装储存中的质量控制，还包括饲料配方的质量控制。为实现对饲料产品的质量控制，需要建立原料、添加剂的质量标准，产品的质量标准，加工、储存、运输中的质量控制标准和作业标准，并要对所有的有关人员进行技术培训，使他们能胜任岗位要求并实施正确操作，确保质量控制目标的达成。