1983年6月，总参谋部、总政治部、总后勤部将卫生监督职能授予团卫生队、机关院校门诊部以上卫生机构。1989年11月，三总部又明确师以上卫生部门负责卫生监督管理，授权各级卫生防疫队、卫生防疫检验所、防疫所和团以上单位执行卫生监督职能。1992年，总后勤部卫生部规定了全军卫生监督监测体系。2008年，解放军疾病预防控制中心成立全军卫生监督中心，协助拟制军队卫生监督法规和规章、组织指导全军卫生监督管理工作、指导全军卫生监督员的聘任和培训工作，拟制全军卫生监督工作规划、计划，负责军队重大公共卫生事件卫生监督的组织工作，协助组织实施全军卫生监督争议的复议和裁定等。