生药鉴定材料不同（完整、破碎、粉末）、生药种类及药用部位不同，选择的显微鉴定方法也不同。鉴定时，首先要制备显微鉴定样品，然后依法进行观察、描述和鉴别。生药显微鉴定样品制备主要有以下六种方法。

取供试品欲观察部位，经软化处理后，用徒手或滑走切片法，切成10～20微米的薄片。必要时可包埋后切片。选取平整的薄片置于载玻片上，根据观察对象不同，滴加甘油醋酸试液、水合氯醛试液或其他试液1～2滴，盖上盖玻片。必要时滴加水合氯醛试液后，在酒精灯上加热透化，并滴加甘油乙醇试液或稀甘油，盖上盖玻片。

供试品粉末过四或五号筛，挑取少许置于载玻片上，滴加甘油醋酸试液、水合氯醛试液或其他适宜的试液，盖上盖玻片。必要时，按上法加热透化。

将供试品湿润软化后，剪取欲观察部位约4毫米²，一正一反置于载玻片上，或撕取表皮，加适宜的试液或加热透化后，盖上盖玻片。

将供试品切成长约5毫米、直径约2毫米的段或厚约1毫米的片，如供试品中薄壁组织占大部分，木化组织少或分散存在，采用氢氧化钾法；若供试品质地坚硬，木化组织较多或集成较大群束，采用硝铬酸法或氯酸钾法。

氢氧化钾法。将供试品置试管中，加适量5%氢氧化钾溶液，加热至用玻璃棒挤压能离散为止，倾去碱液，加水洗涤后，取少量置于载玻片上，用解剖针撕开，滴加稀甘油，盖上盖玻片。

硝铬酸法。将供试品置于试管中加适量硝铬酸试液，放置至用玻璃棒挤压能散为止，倾去酸液，加水洗涤后，照上法装片。

氯酸钾法。将供试品置于试管中，加硝酸溶液（1～2滴）及少量氯酸钾，缓缓加热，待产生的气泡渐少时，再及时加入少量氯酸钾，以维持气泡稳定地发生，至用玻璃棒挤压能离散为止，倾去酸液，加水洗涤后，照上法装片。

取花粉、花药（或小的花）孢子或孢子囊群（干燥的供试品浸于冰醋酸中软化），用玻璃棒研碎，经纱布过滤至离心管中，离心。取沉淀加新配制的醋酐与硫酸（9∶1）的混合液1～3毫升，置于水浴上加热2～3分钟，离心。取沉淀，用水洗涤2次，取少量沉淀置于载玻片上，滴加水合氯醛试液，盖上盖玻片，或加50%甘油与1%苯酚各1～2滴，用品红甘油胶（取明胶1克，加水6毫升，浸泡至溶化，再加甘油7毫升，加热并轻轻搅拌至完全混匀，用纱布过滤至培养皿中，加适量碱性品红溶液〔碱性品红0.1克，加无水乙醇600毫升及樟脑油80毫升，溶解〕，混匀，凝固后即得）封藏。

坚硬的动物、矿物类药，可采用磨片法制片。选取厚度1～2毫米的供试材料，置于粗磨石（或磨砂玻璃板）上，加适量水，用食指、中指夹住或压住材料，在磨石上往返磨砺。待两面磨平，且厚度数百微米时，将材料移置于细磨石上，加水，用软木塞压在材料上，往返磨砺至透明，用水冲洗，再用乙醇处理，用甘油乙醇试液装片。