位于西藏西南部，发源于日喀则市聂拉木县波绒乡色隆村以上的希夏邦马峰北麓情康加勒冰川区，经定日县、萨迦县、岗巴县、定结县，在陈塘附近的龙堆村南8千米处流入尼泊尔境内，为阿润河，最后汇入恒河。国境内流域面积24272平方千米，河长361千米，落差3325米。朋曲支流众多，较大支流多位于干流的左侧。左岸集水面积16357平方千米，右岸集水面积8950平方千米，流域不对称系数为0.585。流域面积大于300平方千米的左岸支流有朋秋曲、吉马曲、洛洛曲、叶如藏布，右岸支流有朗弄曲、甲拉曲、铜曲、热曲、绒布曲、卡达曲。其中，叶如藏布最大，绒布曲次之。

流域南部高山、极高山众多。海拔大于8000米的山峰有五座，即珠穆朗玛峰、洛子峰、马卡鲁峰、卓奥友峰和希夏邦马峰。海拔大于6000米的山峰有40余座。南部和西南部分布着大面积的现代冰川。流域地跨高原亚温带半干旱季风气候、亚热带季风气候。域内空气稀薄，气压低，太阳辐射强，年平均日照时数达3300小时。气温低，年温差小，日温差大。流域多年平均年降水量约600毫米，降水主要由西南季风带来的暖湿气流所致，6～9月降水量占年降水量的90%左右，7、8月的降水量占全年的70%左右。流域南部降水量大，北部降水量小，流域的西部比东北部降水量较大。北部平均年降水量约300毫米，南部陈塘一带平均年降水量约1000毫米，局部地区可达1500毫米。多年平均气温约2.4℃。年蒸发量约1638毫米。朋曲径流以降水、融水和地下水补给，流域内定结县城以北区域多年平均年径流深在150毫米左右，定结县城以南区域多年平均年径流深150～1000毫米。流域水力资源理论蕴藏量约298万千瓦。

河流分为：①上游。源头至岗嘎镇，又称曼曲或朋秋雄曲。河长146千米，落差1180米。有朗弄曲、朋秋曲、热曲等支流汇入。源头以下河道左岸的阶地高出水面约20米，宽50～80米，阶地平坦，后缘与古冰川侧碛相连。上游段大部分为高原宽谷，只在昆昨到休莫间有两个峡谷段，上峡谷称门卡堆峡谷，下峡谷称休莫峡谷。出休莫峡谷后，进入古错盆地，河谷宽达5千米左右，河道曲折，多叉流。②中游。岗嘎镇至叶如藏布汇入口，长121千米，落差200米，河流沿中国－尼泊尔公路向东流，有洛洛曲、叶如藏布等支流汇入。中游谷宽2～3千米，河道宽浅、弯曲、多汊，水面宽80～200米，两岸阶地和洪积扇发育。在鄂尔巴附近有四级阶地，分别高出水面10米、20米、35米和45米。协格尔桥附近有三级阶地，分别高出水面3～5米、10米、15米。③下游。叶如藏布河口以下，长94千米，落差1945米。河流转向西南流，经扎乡，纳入扎嘎曲（见图）、塔居曲后转向南流，至陈塘镇。下游河道为连续的高山峡谷河道，山高坡陡，水流湍急。从叶如藏布河口至康工的两县界河两岸有高出水面35～45米的砂砾石层阶地。康工到扎嘎曲汇入口之间是康工峡谷，峡谷长16千米，两岸岩石裸露，河床嵌入基岩。从扎嘎曲汇入口至卡达曲汇入口为宽约1千米的宽谷河段。卡达曲汇入口以下，又进入V形龙堆峡谷段。龙堆峡谷长约36千米，水面落差1340米。河流在陈塘镇下游约7千米处流出国境。

 扎嘎曲（左）汇入朋曲（中）

流域内耕地面积1.682万公顷。下游陈塘一带温暖多雨，森林资源丰富，可种植鸡爪谷等作物，一年两熟。中上游流域地势较高，气候干燥，为农牧区，种植的农作物有冬小麦、青稞、油菜等，饲养的牲畜有牛、羊、猪等。水、旱、雪、病虫害等灾害时有发生。流域的大部分属珠穆朗玛峰自然保护区。著名景点有珠穆朗玛峰和绒布寺、协格尔镇的宗山等。