中国幅员辽阔，南北跨越约50个纬度，拥有热带、亚热带、暖温带、中温带、温带五个温度带和一个高原气候区，地形地貌复杂，自然条件优越，蕴藏着极为丰富的中药资源。中国自然区划，根据全国的地貌、气候、土壤、植被等自然因素，将全国陆地划分为东部季风、西北干旱和青藏高原三大（一级）自然区域，再依据气候条件，特别是温度条件划分为十四个（二级）自然带。

中药资源中的药用生物的自然分布受气候、土壤等环境条件的限制，同时也是自然环境的重要组成部分。中药资源的矿物资源自身就是地质环境的组成部分。中药资源仅少量分布在海洋中，绝大部分分布在各区域的森林、草原、荒漠、江湖和农田等各种陆地生态系统中。

该区域地处中国东部，属于湿润半湿润季风气候，雨热同季，适于多种药用植物生长，植被景观以森林和农田为主，野生药用植物常分布于森林、灌木丛、草坡、农田和路边，植物类药材的栽培基地绝大多数分布在这一区域。根据温度、降水、地貌等自然条件，该区域可分为五个区域单元。

包括东北三省（黑龙江、吉林、辽宁）大部和内蒙古东北部地区，分布的药用植物有1600余种。区内有大小兴安岭、长白山和松辽平原。该区是中国最寒冷的地区，热量资源不够充足，大部分地区年降水量为400～700毫米，植被以针叶林为主，南部地区有针阔混交林，土壤有寒温带的漂灰土，中温带的暗棕壤、黑土和黑钙土。该区为人参、北五味子、细辛等药材的集中产区。

包括山东、河南、北京、天津、河北和山西的中部及南部、陕西省北部和中部、辽宁南部、宁夏中南部、甘肃东南部，以及安徽和江苏北部地区，分布有药用植物1500余种。该区夏季较热，冬季寒冷，雨热同季，大部分地区属于暖温带，植被以针阔混交林为主，东部丘陵山地为棕壤，中部丘陵山地为褐土，黄土高原为黑垆土，黄淮海平原主要是潮土和盐渍土。该区为北柴胡、金银花、黄芩、桔梗、知母等药材的主要产区。

包括浙江、江西、上海全境，江苏和安徽的中部及南部、湖北和湖南的中部及东部、福建中部和北部，以及河南和广东的小部分地区。区内有秦岭、淮阳山地、南岭山地、长江中下游平原、江南丘陵地区。该区雨量和热量较充沛，北亚热带地区植被为常绿落叶阔叶混交林，中亚热带地区主要为常绿阔叶林，北部分布着黄棕壤，南部分布有黄壤与红壤，分布有药用植物2500种。该区为浙贝母、菊花、麦冬、玉竹、太子参、辛夷等药材的主要产区。

该区包括贵州、云南、四川的大部分、湖北和湖南西部、甘肃东南部、陕西南部、广西北部及西藏东部。该区有秦巴山区、四川盆地、云南高原、贵州高原。该地区热量雨量丰富，北亚热带地区植被为常绿落叶阔叶混交林，中亚热带地区主要为常绿阔叶林，土壤类型有黄褐土、黄壤、红壤和石灰土等，分布有药用植物4500余种，四川盆地分布有大量栽培药用植物资源。该区为川芎、黄连、附子、三七、川乌、川牛膝、石斛、当归等药材的主要产地。

该区包括海南、台湾及南海诸岛、福建东南部、广东南部、广西南部及云南西南部。区内有近沿海地区的山地和丘陵、珠江三角洲、台湾和海南及雷州半岛。该地区高温多雨，冬暖夏长，干湿季节比较分明，年降雨量达1500～2000毫米，植被主要为常绿阔叶林、热带季雨林，土壤以砖红壤为主，另外还有红壤及山地黄壤等，分布有药用植物3800余种。该区为广藿香、巴戟天、砂仁、肉桂等药材的主要产地。

气候干旱为该区最显著特点，其植被由东至西为草原、荒漠草原和荒漠，其间分布多座高山，以耐旱性温带草本药用植物分布为主。根据干旱强度分为两个地域单元。

该区包括黑龙江省中南部、吉林省西部、辽宁省西北部、河北及山西省的北部、内蒙古自治区中部及东部。该区冬季寒冷干燥，夏季凉爽，常年多风，东部年降水量为700毫米左右，到西部降到200毫米左右，植被为典型草原或荒漠草原，山上有森林，东部平原为黑土、草甸土，野生药用植物1000余种，为甘草、麻黄、防风等药材的主要产区。

该区包括新疆全部、青海及宁夏北部、内蒙古西部，以及甘肃西部和北部。区域内日照时间长，干旱少雨，一般地区年降水量仅20～200毫米，山区200～700毫米。戈壁、荒漠和荒漠草原是该区主要景观，山地和河岸有森林植被，土壤有灰棕漠土、灰漠土、棕钙土和灰钙土等，分布有药用植物2000余种。该区为新疆软紫草、伊贝母、羌活、独活、阿魏等药材的主要产地。

该区包括西藏自治区大部分、青海南部、四川西北部和甘肃西南部。区内地势复杂，山脉纵横，多高山峻岭。该区气候寒冷，日照强烈，降水量差异较大，植被主要有高寒灌丛、高寒草甸、高寒荒漠草原、湿性草原，以及温性干旱落叶灌丛，土壤有高山草甸土和寒漠土，约有药用植物1100种。该区为冬虫夏草、雪莲花、雪上一支蒿等药材的主要产地。

该区药用动物资源丰富，约300多种，主要有马鹿、黑熊、蟾蜍、全蝎等。

该地区是季风区及蒙新区动物相互混杂的地带，药用动物种类近250种。其动物类药材主要有土鳖虫、蜈蚣、阿胶、五灵脂等。

该地区有药用动物300多种。出产动物类药材主要有蟾酥、地龙、金钱白花蛇、穿山甲等。

该地区有药用动物300多种。出产动物类药材主要有麝香、熊胆、水蛭、僵蚕等。

该地区有药用动物200多种。出产动物类药材主要有蛤蚧、燕窝、穿山甲等。

该区出产的动物类药材主要是牛黄，另外还产出夜明砂、鹿茸、鸡内金、狗肾等。

该地区分布有药用动物160多种，出产动物类药材主要有羚羊角、鹿角、龟甲等。

该区出产的动物类药材最主要是鹿茸和麝香，另外还有熊胆、鹿角、牦牛骨等。

该地区分布药用矿物50多种，主要有龙骨、龙齿、大青盐、花蕊石等。

该地区有药用矿物30多种，主要有代赭石、滑石、金礞石、龙骨等。其中，陕西吴起县的“五花龙骨”最负盛名。

该地区矿物药分布主要有磁石、寒水石、自然铜、云母、钟乳石、阳起石等。

该地区分布的药用矿物有80种左右。如石膏、鹅管石、朱砂、水银、自然铜、龙骨等。

该地区有药用矿物30多种，主要有硫铁矿、赤铁矿、琥珀、海浮石等。

该地区的药用矿物以龙骨、芒硝、大青盐、石膏为主，还产有炉甘石、紫石英、玛瑙等。

该地区有药用矿物60多种，主要有云母石、密陀僧、磁石、炉甘石、光明盐、大青盐等。

该区域分布的药用矿物主要有朱砂、雄黄、石膏、龙骨、硼砂、玛瑙等。