在一些情况下，间性人的特征在出生的时候就显现了，有些特征在青春期的时候才显现，还有一些染色体特殊的间性人特征根本从身体上看不出来。通常，间性人会遭遇很多歧视，有些间性人一生下来就被杀死或抛弃，而间性人的家庭也遭遇污名化。有些医院对间性人进行医疗干预以使其获得社会接纳也被一些人权组织所批评，因为有些早期干预没有经过当事人的同意，有些干预手段（如绝育）也被认为过于残酷。

2015年，马耳他成为首个法律明文禁止非自愿的性别生理结构矫正干预的国家。该法规的保护对象就包括了间性人。在一些情况下，间性人因为未成年而在法律上没有表达同意的能力，家长会代其同意医生为其进行矫正手术。很多社会组织和人权机构呼吁禁止为了性别的“正常化”而进行非当事人同意的手术矫正。这种观点认为，间性人在不需要手术矫正的情况下，也可以活得很好。美国哲学家J.P.巴特勒（Judith Pamela Butler, 1956～ ）认为，传统僵化的性别二元结构制造了对人的界定及人应过的生活的区分，因而对其持批判反对的态度；认为间性人的存在证明了性别二元关系并未涵括一切，也非必要。