标记率用来描述同一放射性核素的各种化学形态之间的相对数量关系，一种放射性核素可以具有不同种价态，每种价态又可形成不同化合物。

常用的标记率测定方法有放射性纸层析法、薄层层析法、柱层析法和蛋白沉淀法等。

①纸层析法。纸层析法以滤纸作为支持体，以适当的溶剂作为流动相的分配层析法。纸层析法按操作方法不同又可以分为单向法、双向法、圆形法以及上行法、下行法等。

②薄层层析法。薄层层析法一般属于固相液相层析，其固定相用某些固体物质粉末加入一定量黏合剂均匀涂在玻璃片上制成，可分为分配层析、吸附层析、离子交换层析、凝胶过滤层析等。薄层层析的操作过程与纸层析相似，也包括点样、展开、显色、测定放射性分布等步骤。与纸层析法相比，具有吸附容量大的优点，但操作麻烦。

③蛋白沉淀法。利用放射性核素的某一化学形态能与一定的试剂形成沉淀而与其他化学形态相分离的方法。例如，测定放射性碘标记的蛋白质的放射化学纯度，可以利用三氯醋酸把蛋白质沉淀下来而与游离的放射性碘分开。

此外，测定标记的生物大分子的标记率时，凝胶过滤色谱也很常用。