由于使用方往往只注意洁净度或细菌浓度是否达标，对其他性能和施工做法不关心，将给洁净室质量带来隐患。例如，照度、噪声不达标，虽然洁净度达标，也会影响工人的操作而危及质量；又如虽然洁净度达标了，例如8级，但这是在50～60次换气条件下达到的，这并不能说明真能达标；又如洁净度达到5级了，但截面风速只有0.1米/秒，在静态条件下可能满足洁净度要求，但人稍有动作或出现其他干扰，这个洁净室的抗干扰能力就显得太低了，洁净度一定保证不了。

综合性能评定的检测项目包括必测项目和一些选测项目（见洁净环境检测）。