潜流人工湿地分为水平潜流人工湿地和垂直潜流人工湿地，在欧洲和日本应用较多。

主要特点：①可充分利用填料提供的表面和植物根系，占地小。②累积在填料表面的植物残体能在寒冷气候下具有较好的热保护和保湿作用。③卫生条件较好，它可以处理较高负荷的废水，但投资高。④实际应用中若有机负荷过大，常堵塞。过度的堵塞会导致潜流人工湿地系统水力传导性能下降、潜流人工湿地表面形成积水、处理效果下降等问题。

为了维持水流在床体中的流动，湿地中一般使用具有良好空隙、水流易于通过的填料，如砾石、炉渣、沸石或沙等。并且为了保证潜流污水在床内的均匀流，一般需要布置合理的床内布水与集水系统。

潜流湿地的植物根区填料层通常由3层组成：表层土壤、中层砾石和下层小豆石。污水经过配水系统一般由卵石构成在湿地的一端均匀地进入填料床植物的根区。在表层土壤上往往种植一些根系发达的耐水植物。这些植物的根系可以深入到表土以下0.6～0.7米的砾石层，并交织成网与砾石一起构成一个透水性良好的系统。植物根系具有较强的输氧能力，可使根系周围的水环境中保持较高浓度的溶解氧，供给生在砾石等填料表面的好氧微生物的生长和繁殖，以及为有机物的降解供氧。