电子商务公共服务中心通常有两种运营方式。一种是由政府采取购买服务的形式，通过向社会公开招标，遴选有提供电子商务公共服务条件、服务能力和运营经验的组织来运营管理，为全社会提供电子商务公共服务；另一种是由政府招聘一批具有电子商务应用经验，并且熟悉电子商务服务运作的专业人员，成立或指定专门的组织机构来运营管理，负责为社会提供电子商务公共服务。

电子商务公共服务中心拥有固定的服务场所和工作人员，建有服务大厅及其服务站点，服务窗口通过电子商务公共服务软件系统（又称为公共服务平台）为社会提供各种线上和线下的服务，包括电子商务公共服务的信息、资源和能力，服务内容主要有法律法规、政策制度、产业园区、社会资源、技术支撑、合作协作、产权交易、营销服务、投融资服务、人才培训、管理咨询、市场监管、报表统计和数据分析等服务功能。

电子商务公共服务中心的服务场地要求交通便利、设施齐全、功能完备、服务配套。服务中心的建设应根据地方经济发展的特点和产业电子商务应用优势，规划服务部门及其服务内容，重点是为产业发展提供支撑服务，内容包括法务服务、产品服务、品牌服务、营销服务、标识认证服务、质量追溯服务、订单履约服务、客户响应服务、移动商务服务、O2O体验服务、物流配送服务、市场监察服务等，以便本地快速形成电子商务特色应用优势产业。

电子商务公共服务中心是面向社会提供服务的公共机构，其服务对象主要是政府、企业及公众。面向社会的服务设施和服务系统应该能够完成电子商务应用所需要的信息、物流、金融、保险、技术和管理等基本服务要求。

电子商务物流领域的公共服务是制约电子商务发展的关键环节，电子商务物流公共服务场地要提前规划，要为未来的经济发展预留空间，建立适应生鲜产品电子商务应用的仓储、加工、运输和配送冷链物流公用设施及公共服务系统，为社会提供低温环境下的产品仓储、分拣、加工、包装、运输等物流配套公共服务，以及产品安全检测和质量溯源公共服务。除此之外，电子商务公共服务中心在为社会提供公共服务时，还要能够实现线上和线下、跨时空、全方位、多功能的电子商务服务，为企业提供包括项目对接、成果转让、产品孵化、产业融合、品牌传播、营销策划、信用服务、金融服务、人才培训以及其他衍生增值服务功能的电子商务公共服务内容。