疏浚工程所造成的污染主要集中在施工期，会影响海水水质环境和海洋生态系统。

①对海水水质的影响。施工过程中施工船舶洒漏的颗粒物及施工机械搅动海底产生的再悬浮颗粒物，会增加海水的浊度，导致溶解氧含量和水体透光率下降，同时，泥沙中携带的有毒有害物质也可能会扩散，降低海水质量。如中国南海海港疏浚淤泥的悬浮物中铅（Pb）、镉（Cd）和锌（Zn）等金属含量超标，这些金属对鱼类和浮游甲壳类生物都具有急性毒性效应。

②对海洋生态系统的影响。疏浚工程造成的水质污染会影响鱼类、浮游生物和底栖生物的生长繁殖。例如，悬浮颗粒会黏附在浮游生物体表，影响其正常的生理功能，特别是当浮游动物吞噬了较大的悬浮颗粒时会引起其内部消化系统紊乱，存在致死风险。光线透过率低，溶氧减少会降低浮游植物的光合作用水平，影响其类型和数量，降低该海域的初级生产力水平。悬浮颗粒还会随鱼类的呼吸而进入鳃部，损害呼吸器官，实验证实，疏浚悬浮物暴露会损害鳞鲻幼鱼的鳃部，导致鱼体缺氧窒息。此外，悬浮颗粒还会影响鱼卵和仔鱼的存活。对于底栖生物而言，疏浚过程对海底的扰动会摧毁建设区域内底栖生物的栖息地，影响其生存。

为降低疏浚工程对海洋环境的危害，实现环境保护的目的，可以采取以下措施：①提高施工效率，缩短施工期限。将施工时间尽量缩短可以有效减少对海洋环境的损害。②合理安排施工时间。尽量避免在海洋生物的繁殖期施工，同时考虑潮位和流速，缩小悬沙的扩散范围。③疏浚土的综合利用。将疏浚土用于吹填造陆、筑堤护岸等，既节约资源又保护环境。④规范施工，在挖泥、运输、弃土或吹填过程中，根据疏浚对周围环境保护目标影响程度，结合环保要求做好防污措施。⑤对受损的海洋生物进行增殖放流，放流受损生物的幼苗可以缓解疏浚工程对海洋生物资源造成的危害。