海洋环境监理包括海洋环境巡视、海岸工程监理、陆源环境监理、船舶污染监理、入海污染物的海上倾倒废弃物监理、海洋石油开发环境监理等。

因海洋环境涉及因素复杂、范围广泛，为对其进行有效管理，国家规定要建立由国务院环境保护行政主管部门统一协调和监督、国家有关部门分工负责、中央和地方分级管理的海洋环境管理体系：①国务院环境保护行政主管部门作为全国环境保护工作的统一监督管理部门，对全国海洋环境保护工作实施指导、协调和监督，负责全国防治陆源污染物和海岸工程建设项目对海洋污染损害的环境保护工作。②国家海洋行政主管部门负责海洋环境的监督管理，组织海洋环境调查、监测、监视、评价和科学研究。负责防止全国海洋工程建设项目和海洋倾倒废弃物对海洋污染造成损害的监督管理。③国家海事行政主管部门负责所辖区水域内非军事船舶和港区水域外非渔业、非军事船舶污染海洋环境的监督管理，并负责污染事故的调查处理，对在中华人民共和国管辖海域航行、停泊和作业的外国船舶造成的污染事故进行登记、检查和处理。④国家渔业行政主管部门负责渔港水域内非军事船舶和渔港水域外渔业船舶污染海洋环境的监督管理，保护渔业水域生态环境及渔业污染事故的调查处理；军队环境保护部门负责防止军事船舶污染海洋环境的监督管理及污染事故的调查处理。⑤沿海县及县以上地方人民政府行使海洋环境监督管理权的部门的职责，由省级人民政府确定。

①实现海洋管理部门对项目全过程的管理。依据《中华人民共和国海洋环境保护法》《防治海洋工程建设项目污染损害海洋环境管理条例》等法律条文，对海洋工程实施海洋环境监理，弥补监管手段的不足，有效控制施工过程中的环境污染与生态破坏，确保环保措施真实有效，使“事前”和“事后”管理转变为“全过程”管理。②降低或规避项目潜在环境风险。通过开展由建设单位委托第三方进行环境监理，可以确保相关环保工程按照设计文件保质保量进行建设，避免了项目营运期出现环境污染事故以及出现问题后整改难度大、资金重复投入造成浪费等情况的发生。③推进环境影响评价进一步深化和提升。通过实施海洋环境监理，可以对环境影响评价的预测结果进行验证，将现场环境管理中遇到的实际问题反馈到环境评价工作中去，使环评报告书中的对策措施更具针对性和可操作性，推进环境影响评价进一步深化和提升。④为环保竣工验收打下良好基础。