海洋环境地质调查包括海洋沉积物、海洋地形地貌、海洋沉积动力条件和海洋灾害地质的调查。海洋沉积物调查包括表层样、柱状样和钻孔样品。海洋沉积动力调查包括海洋动力因素观测、悬浮体观测等。海洋灾害地质的调查是对海底表层灾害和海底埋藏灾害的综合性地质-地球物理调查，主要采用单道地震、多道地震、浅地层剖面测量、旁侧声呐扫描、单波束水深测量、多波束水深测量、海底地震勘探等技术方法，尤其强调海底原位、实时监测技术的应用。

海洋环境地质调查基本内容包括海上地质调查和海上地球物理数据采集。地质调查的样品在实验室分析，获得测试数据。地球物理获取后，利用专用软件对海上实测原始数据进行处理，然后综合地质测试数据进行综合解释。综合解释工作主要包括利用钻孔数据和浅地层剖面研究地质历史演化及地层空间结构、利用表层样和柱状样揭示海底浅表层沉积环境及污染分布，以及利用水深测量数据、侧扫声呐图像、沉积动力等分析地质灾害成因、分布、影响等。

常用的调查手段包括海上定位、表层取样和柱状取样、测深、沉积动力调查、浅地层剖面测量、旁侧声呐扫描、水下电视和摄影、深潜装置观测、海底钻探等。表层样品主要用箱式或蛤式取样器取得。柱状样采用震动取样器或重力取样器获取。海底钻探需要使用钻机和套管，进行全取心获得样品。沉积动力调查需要多普勒流速仪测流计、取水器、浊度计等进行作业。浅地层剖面测量、旁侧声呐扫描、水下电视和摄影、深潜装置观测等地球物理调查专门仪器。

海洋环境地质调查是海洋环境保护、海岸带综合治理、海洋工程建设、海洋灾害防治及海底矿产资源勘查开发等的一项基础性工作。