农业产业结构合理化是农业可持续发展的基本要求，农业可持续发展强调农业产业经济发展的整体性、系统性、协调性、稳定性、持久性，要求整个农业生产部门的比例协调、生产结构与需求结构基本一致，能够避免严重的过剩和短缺，防止不均衡、畸形发展。

农业产业结构是否合理，是一个相对的和发展的概念，应视农业产业结构状况与客观要求的适应程度而定。同时，评价一个地区的农业产业结构合理化程度，不能只进行微观分析，还要从全局出发进行宏观考察。农业产业结构合理化的评价标准有以下4个。①能充分合理地利用当地农业资源，不断提高经济效益。农业各部门的发展规模和速度要与农业的自然、经济资源条件相适应。在自然资源的利用上做到宜农则农，宜林则林，宜牧则牧，宜渔则渔；在经济资源的利用上，做到农业劳动力、资金、设备等充分发挥作用，不断提高经济效益。②能保持和改善生态环境。合理的农业产业结构应能保持和建立生态平衡，使生态系统呈良性循环，改善优化生态环境，直接提高人们的生活质量，提高生物和自然环境之间的物质和能量的转换率，增加农业产出。③能更好地满足社会需求。随着国民经济发展和人民生活水平提高，社会对各种农产品的需求不断增长，对农产品需求的结构和比例也会发生变化。这就要求农业产业结构不断做出相应调整，以最大限度地满足社会各方面的需求。④农业各部门能协调发展。合理的农业产业结构应是农业各部门获得协调发展的结构。只有遵循农业各部门间相互促进、相互补充的关系，才能实现相互间的协调发展。

农业产业结构合理化的指标体系，包括反映农业产业结构状况的指标和反映农业产业结构的效益的指标。①反映农业产业结构状况的指标。包括土地利用结构、播种面积结构、农业总产值结构、农业商品产值结构、农业劳动力利用结构和资金利用结构。②反映农业产业结构的效益的指标。包括反映经济效益的指标、反映社会效益的指标和反映生态效益的指标。其中反映经济效益的指标主要有单位面积产量（产值净产值），劳动生产率单位产品成本，每元投资所得的产值、净产值、商品产值等；反映社会效益的指标主要有农产品商品量及其构成、农产品商品率、主要农产品的人均占有量等；反映生态效益的指标主要有森林覆盖率，自然灾害发生率，土壤有机质含量，土壤和水资源中有害物质含量等。

遵循上述评价标准，根据评价指标体系，可利用以下方法衡量农业产业结构合理化程度。①比重法。根据各次产业产值在产业结构中的百分比确定其合理的程度。②类比法。用一个地区的产业结构同另一个地区相比，以判断该地区产业结构的合理程度。③速度法。一个部门的速度同另一个部门的速度比较，或用一个部门现在速度同过去的速度比较，以判断结构是否合理。④协调法。从系统的观点出发，研究农业产业结构运动的内在规律性，综合考查部门之间在一定时期的合理比例关系，在研究方法上吸收比重法、类比法和速度法等方法的优点综合判断。