水行业管理包括对原水、自来水的生产和供应、排水及污水处理等业务活动进行专业化分类管理。从主体的角度主要分为三类。①水文工作行业管理。统一规划全国水文站；统一制定水文测验﹑水文试验﹑水文资料分析整编﹑水文计算﹑水资源调查评价的规程规范；统一刊布水文年鉴；统一发布水情预报；统一规定水文测验、器械、仪表标准并会同有关部门发放资格认证书；统一调处有关水文资料和水文计算中发生的技术性争议等。②水工程建设和开发的行业管理和监督。统一制定水利水电工程基础处理、主体工程施工中重大问题处理方面的规范规程和已建工程存在遗留问题或隐患的处理规定等，并监督执行。③水利队伍建设行业管理。对从事水工程规划、设计和施工的单位进行资质审查，统一认定技术等级、工作范围并发放资质证书；制定有关技术标准和预算施工定额；制定水工程发包承包制度并监督实施；建立施工监理和质量监督制度，协调处理在建设过程中发生的纠纷和争议等。

水行业管理已由过去国家单一投入，逐步过渡到以地方政府为主，依靠群众和各行业、各部门的财力、物力、多层次﹑多渠道集资投劳，社会办水利的局面。但社会经济活动中很多人对什么是行业管理，水利行业管理的内容、职责是什么，为何要加强水利行业管理，如何加强水利行业管理等知之甚少。因此，贯彻水法、水法规，振兴水利基础产业的当务之急是强化水利行业管理意识。这需要中国进一步转变观念，切实转变职能。从大方面来说，要从产品经济观念转变为商品经济观念。具体而言，即从直接管理的观念转变为宏观管理、间接管理的观念，从传统部门管理观念转变为全行业管理观念，不断摸索适应社会主义市场经济的水利行业管理体系。维护和发展行业利益，协调行业利益与国民经济整体利益的关系，充分发挥现有上千亿水利固定资产的效益，使水利行业稳定发展，从而促进国民经济的持续﹑稳定发展。