肠球菌属常成对排列或短链，形态与链球菌类似，无芽孢和鞭毛。原归于链球菌属（D群链球菌），现根据种系分类法命名为肠球菌属。

乳酸发酵阳性但不产气。通常可在10～45℃生长（最适37℃)，耐高盐和碱性条件，且在40%胆盐中也能生长（该特点不同于链球菌）。该菌在40%胆汁培养基中可分解七叶苷，氧化酶和触酶试验阴性，多数菌种能水解吡咯烷酮-β-萘基酰胺（PYR），并对许多抗菌药物表现为固有耐药。

已发现19种肠球菌，其中与人类疾病有关的是粪肠球菌（Enterococcus faecalis）和屎肠球菌（Enterococcus faecium），为机会致病菌。常定植在人和动物的口咽部、肠道黏膜、女性生殖道等部位。可根据其对糖的利用进行区分。粪肠球菌是人和动物肠道正常菌群组成部分，存在于人和动物的上呼吸道、消化道、生殖道内，具有较强的耐受性和定植能力。广泛分布于畜、禽养殖场所和畜禽产品生产加工的环境中。粪肠球菌是肠球菌感染中最常见的致病菌。随着抗生素的广泛实用，粪肠球菌逐渐出现了耐药株。中国细菌耐药监测网（CHINET）显示粪肠球菌耐药率低于屎肠球菌，但氯霉素耐药率要高于屎肠球菌。粪肠球菌可在输尿管支架、血管内导管、胆道支架、硅胶胃造瘘装置表面等形成生物膜。粪肠球菌能产生细菌素等抑菌物质，抑制大肠埃希菌和沙门氏菌等病原菌的生长，改善肠道微环境。屎肠球菌也是人和动物肠道内正常菌群组成部分，感染率低于粪肠球菌。免疫力低下或者儿童易感染，但其感染率呈逐年上升趋势。中国细菌耐药监测网显示，除氯霉素外，屎肠球菌对其他抗菌药物的耐药率均高于粪肠球菌。屎肠球菌对高水平庆大霉素、青霉素和左氧氟沙星的耐药率可达到90%以上，对链霉素耐药率达60%，对四环素的耐药率接近40%。耐万古霉素肠球菌（VRE）感染已引起越来越多的重视。数据显示，VRE以屎肠球菌为主。多重耐药屎肠球菌感染的治疗是临床上的棘手问题。

肠球菌在一定条件下（如免疫力低下、表皮黏膜破损及过度使用抗生素而引起菌群失调等），可引起泌尿道、血流、腹腔内、盆腔内甚至中枢神经系统的感染。由于免疫抑制剂的广泛使用和侵入性治疗的增加，肠球菌逐步成为引起医院感染的重要病原菌，以尿路感染、腹部和盆腔等部位创伤和术后感染等为常见。临床上分离率最高的是粪肠球菌，其次是屎肠球菌。

肠球菌对多种抗菌药物呈固有耐药，且肠球菌耐药现象日趋严重，甚至出现万古霉素耐药菌株或利奈唑胺耐药菌株。

粪肠球菌和屎肠球菌还被作为益生菌研发成微生物制剂，用于调节肠道微生物群。