1721年，沙皇彼得一世改革教会，建立主教公会，以代替牧首制，并制定新的宗教事务管理条例。公会由沙皇任命的多位主教以及官员组成。原先参议的主教有十位，之后增至十二位。其成员包括圣彼得堡、莫斯科、基辅的都主教和格鲁吉亚的督主教。公会成员必须宣誓效忠于沙皇政府。主教公会有权决定教会重大事项和部分世俗事务。主要职责是监督东正教信仰的发展方向，指导信徒的宗教生活，庆祝圣餐以及决定神品、礼仪等问题。主教公会有防止异教信仰、判定教会神迹和遗物、阻止俄罗斯人从事巫术活动等权力。主教公会控制着教会的财产，因而负责创建修道院和教堂。1917年，沙皇被推翻。次年，东正教又恢复牧首制，主教公会则成为牧首的咨询机构。