采用集中部署运行方式，由中国水利部、流域管理机构、省、市、县各级水行政管理部门及相关涉水组织机构共同参与，协同开展工作。

2007年，中国水利部开始建设全国农村水利管理信息系统，2009年建成；2012年又开始建设全国农村水利管理综合数据库，扩展了行业和项目各类数据，建成农村水利管理综合数据库；2016年开始对全国农村水利管理信息系统进行整合，至2018年建成涵盖农村水利建设项目管理、行业管理改革领域的农村水利管理信息系统。

农村水利管理信息系统由业务数据库和业务应用等两部分组成。①农村水利管理业务数据库。按照面向对象（水利数据模型），将灌区、泵站、塘坝、窖池、机井、渠（沟）道、集中供水工程、县级水质检测中心、灌溉试验站、灌溉面积、高效节水灌溉等对象的空间属性和农村水利管理业务属性，形成统一的业务数据库。②农村水利管理业务应用。依托水利部水信息基础平台——应用支撑平台，构建涵盖农村水利建设项目、行业管理和管理与改革等3个业务应用。通过系统应用，结合空间信息，为用户提供信息的综合查询和展示，实现农村水利行业管理、项目管理和调配决策支持等。系统组成如下图所示。

农村水利管理业务应用组成示意图

系统功能主要包括：①数据填报。根据中国水利部、流域管理机构、省、市、县等5级水行政管理部门及相关涉水组织机构各自职责，支持各单位填报所涉及对象的时间、空间和业务属性。②数据审核。系统设置两种审核方式，即本级数据审核和上级数据审核。③汇总统计。按照逐级汇总统计模式，由各级水行政主管部门开展汇总统计业务，并可逐级下钻，直至具体对象详细信息，汇总统计信息提供列表、图示和地图三种表达形式。

农村水利管理信息系统应用为及时全面掌握行业现状、项目资金投入、工程进度、效益状况及管理体制改革进展，提高国家投资效益和监管力度，保障投资安全，推动农村水利从粗放管理向精细化管理、从静态管理向动态管理的转变提供了有效技术支撑。