在珠三角城市群的基础上，依托创新集群的发展，城市群由生产协同向创新协同转变，发展成为“珠三角”城市创新群。“珠三角”城市创新群内有“珠三角国家自主创新示范区”和“深圳国家自主创新示范区”两大国家自主创新示范区，以民营企业为创新主体，创新创业群体和创业资金密集，市场化程度较高，具有快速响应的先进制造能力。相比“长三角”城市创新群、“京津冀”城市创新群，“珠三角”城市创新群具有相对较强的科技产品转化能力，具备后端创新的优势，其他区域研发出的科研成果通常会选择在“珠三角”城市创新群内进行产品生产及产业化，形成创新型现代产业体系。“珠三角”城市创新群正在形成开放型的区域创新体系，粤港澳合作更加紧密，构建分工协作、优势互补的珠三角创新发展一体化格局。