由于不同制导方式存在不同优点与局限性，特别是随着对武器系统实战化要求的不断提升，对制导精度以及制导系统的实用化要求也在越来越高，而且电子对抗、隐身目标、反辐射武器、饱和攻击、防区外发射武器等威胁的日趋严峻，单一制导方式往往无法满足多方面的需求，因而将不同制导方式适当组合后综合运用，可以扬长避短，发挥各自优势。复合制导系统的特点是，制导设备涵盖地面及弹（箭）上设备，制导精度高，但成本也高。

按照复合方式的不同，复合制导可分为串联式复合、并联式复合及串并联复合三种。

①串联式复合是指在飞行不同阶段采用不同制导体制，其优点是可以提高制导距离、增加射程，是中远程防空导弹的主要制导方式，主要有自主加寻的、自主加指令、指令加寻的、自主加指令加寻的等方式。

②并联式复合是在同一制导段具有多种制导方式，它可以是不同波段的复合（多模制导），也可以是不同种类的复合。这是对付复杂目标环境和抗干扰的有效途径，如微波/红外成像、毫米波/红外成像、红外/紫外、主动/被动等。

③串并复合则是既有不同制导段复合，又有同一制导段复合。不同的复合方式具有不同特点，例如，自主加寻的既可以利用寻的制导的高制导精度特点，又可以利用自主式制导弥补寻的制导作用距离不足等弱点。微波加红外成像既可以利用微波作用距离远、具有全天候使用能力的优点，又可以利用红外成像优良的抗电子干扰能力和反隐身能力，提高其抗干扰能力和低空性能。这样可在使用中根据干扰环境的变化，自适应的转换制导方式来提高武器在复杂环境中的作战能力。