米根霉是中药和酒曲中的重要霉菌。1895年，荷兰首次报道了米根霉，当时被称为少根根霉（Rhizopus arrhizus）。米根霉属于真菌门，接合菌亚门，接合菌纲，毛霉目，毛霉科，根霉属。菌落最初呈白色，后变为褐灰色或黑褐色。米根霉假根发达，呈褐色，指状或根状分枝，假根起固定作用并能吸收养分。米根霉主要靠形成无性和（或）有性孢子进行繁殖。米根霉常规使用马铃薯葡萄糖琼脂（potato dextrose agar; PDA）培养基培养，适宜生长温度为30～35℃。

米根霉对植物具有致病性，主要是由于米根霉能产生大量聚糖降解酶。米根霉的糖分解代谢主要包括糖酵解（EMP）途径和三羧酸循环（TCA）途径，通过EMP途径可发酵糖类物质生成乙醇、乳酸、草酰乙酸、苹果酸和富马酸等产物。

米根霉是安全的工业生产菌株，主要用于发酵大豆和制造豆豉。米根霉可利用淀粉、蔗糖、葡萄糖、木糖等生产乳酸、苹果酸和富马酸等有机酸，也可用于生产淀粉酶、脂肪酶、果胶酶和蛋白酶等酶制剂。