其前身可追溯至成立于1935年的旧都文物整理委员会。1949年，更名为北京文物整理委员会，是中华人民共和国第一个由中央政府主办并管理的文物保护专业机构。1973年，更名为文物保护科学技术研究所。1990年，与文化部古文献研究室合并为中国文物研究所。2007年8月，更名为中国文化遗产研究院。　　

中国文化遗产研究院的主要职责是：开展文化遗产发展战略、管理体制、政策法规、学科体系、标准化体系等方面的科学研究；组织实施中国世界文化遗产地及预备清单动态信息和预警监测系统建设，开展世界文化遗产保护和管理相关研究；开展以全国重点文物保护单位为代表的不可移动文物的勘测、设计、规划、保护、施工、监理等工作；承担国家文物保护对外援助工程；开展文物保存状况调查、文物材质、文物保护材料等研究，开展馆藏文物修复、保护方案设计和组织实施及其效果评价，开展传统工艺技术、现代科技在文物保护中的应用研究，开展行业资质培训、专业技术培训、工程专项培训和国际合作培训；开展出土文献、考古调查、文物保护标准化等研究及国家文物局委托的重大基础工作；承担国家文物局交办的其他事项。

中国文化遗产研究院具有中华人民共和国考古发掘资质、文物保护工程勘察设计甲级资质、可移动文物技术保护设计甲级资质、可移动文物修复一级资质以及文物保护工程施工一级资质等。主要研究领域涵盖了文物保护科技、古代建筑及岩土遗址保护、设计规划以及博物馆、水下考古等多个学科方向，形成了社会科学、自然科学、工程技术科学各具特色又交叉融合的文物保护专业体系。

中国文化遗产研究院与国际重要文化遗产保护机构、学术团体、国外著名科学研究机构和知名大学开展了广泛的交流与合作。国际古迹遗址理事会中国国家委员会秘书处、文物保护标准化技术委员会秘书处等均挂靠在中国文化遗产研究院。