河湖水系连通是流域内河流与湖泊、河道与河漫滩之间以及水系内部物质流、信息流和物种流保持畅通的基本条件。物质流指水体、营养物质、泥沙等物质的流动过程；信息流指为生物提供生命节律信息的水文过程；物种流指洄游鱼类、漂流性鱼卵以及树种在水流中的运动过程。河湖水系连通工程的目的是优化水资源配置；提高防洪减灾能力；改善河湖生态环境；实现生态效益和社会经济效益最大化。

河湖水系连通的分类有：①按驱动因素，可分为自然演进型、人工驱动型、自然-人工复合型等；②按地理位置，可分为北方干旱型、南方湿润型、西南高原型、西北内陆型等；③按水系特点，可分为山区连通型、平原连通型、平原河网型等；④按空间格局，可分为国际连通型、跨流域连通型、流域内连通型、区内连通型、市内连通型等不同层面；⑤按连通目的，可分为资源调配型、环境修复型、灾害防御型、综合效益型等；⑥按连通对象，可分为河河连通型、河湖连通型、河库连通型、河湿连通型、河湖城市连通型、市市水网连通型、河渠连通型、组合连通型等；⑦按连通方式，可分为疏通修复型、连通新建型、阻隔断绝型等；⑧按时间效应，可分为短期效应型、长期效应型等。

人类大规模的生产、建设活动，使河湖水系连通性削弱和破坏，主要表现在：①围湖造田和闸坝控制，阻碍了河湖连通性，导致河湖关系变化以及湖泊退化；②由于水坝建设削弱了河流纵向连通性，导致洄游鱼类受阻；③由于缩窄堤防间距、道路和建筑设施侵占河滩，削弱了河流侧向连通性，导致洪水脉冲效应减弱以及河滨带退化；④城市化进程中地面硬质铺设改变了下垫面结构，阻碍了雨水下渗，造成城市内涝灾害；⑤河道硬质护岸结构，破坏了垂向连通性，阻断了地表水与地下水交换通道。

河湖水系连通规划准则包括：将流域作为恢复河湖水系连通性规划的空间单元；恢复河湖水系连通性规划应与流域综合规划相协调，发挥河湖水系连通的综合功能；以历史上的连通状况和水文-地貌特征为参照系统，确定恢复连通性目标；优化河湖水系连通格局，实现生态效益和经济效益最大化；实施湖泊湿地滩地综合治理，严格控制沿湖沿河的养殖、旅游及房地产开发；恢复河湖水系连通性应与河流湖泊生态修复相结合，实施一体化生态修复；在规划设计阶段，须进行风险分析，充分论证各种不利因素和工程负面影响，制定适应性管理预案。

河湖水系连通措施分为工程措施、非工程措施两大类。工程措施有：①连接通道的开挖和疏浚；②拆除失效的控制闸坝，退渔还湖，退田还湖，恢复湖泊湿地河滩；③拆除岸线内非法建筑物、道路改线；④清除河道行洪障碍，扩大堤防间距，加宽河漫滩；⑤建设洄游鱼类的过鱼设施；⑥生态护岸措施，提高河湖岸坡的透水性、多孔性等；⑦生态减渗措施，利用河床底质重构技术，保持地表水和地下水的垂向连通性。非工程措施有：①改进已建闸坝的调度运行方式，制定运行标准，保障枯水季湖泊、湿地的水量；②建立湖泊健康评价标准，科学确定湖泊环境流量；③依据湖泊生态承载能力，划定环湖岸带生态保护区和缓冲区范围，明确生态功能定位；④实施流域水资源综合管理，对河流、湖泊、湿地、河漫滩实施一体化管理，建立跨行业、跨部门协商合作机制，推动社会公众参与；⑤建设生态监测网，开展河湖水系连通性和水文-地貌-生物状况定期评价。