位于青森县青森市西南郊三内字丸山，地处冲馆川西岸海拔10～30米的台地上。遗址附近尚有与之相关的小三内、三内、近野、浪馆等遗址。1953年调查发掘，1992年起持续发掘。主体遗存属绳纹时代前期中叶至中期末，年代为距今5500～4000年。还发现有绳纹时代后期、晚期和平安时代的遗存。

绳纹时代前期遗存多被扰动或叠压，中期遗存保存相对完整，是一处直径约240米的较完整的圆形聚落，其内部分为不同区域。居址区位于聚落南半部，占地最广，主要包括半地穴房址和坑穴。居址区东北邻为埋葬成年死者的土坑墓区。孩童墓葬多是先收入陶器再行埋葬的瓮棺葬（即“埋设土器群”），埋葬地共有2处：一处沿土坑墓区北缘分布；一处偏于聚落的中北部。

遗址北半部主要有3处柱穴群和2处大土堆。位于聚落中央的柱穴群面积最大，呈东西向展长，其他2处柱穴群分别位于聚落的西部和西北部。

西北部柱穴群中存留的6个柱穴构成了一座面阔两间、进深一间的长方形单体建筑，其柱穴直径约1.8米，穴深2米，穴内残存直径约0.8米的栗木柱根，推测这座建筑高达20米，在聚落中拥有区域中心的地位，对其功能有着不同的解读，如王者高殿、俯瞰津轻海峡的瞭望台、高架仓库等。该遗址也因此而有着“绳纹之都”之誉。

大土堆对称分布于中央柱穴群的南、北两侧，形似小丘，平面皆近“L”形，以砂土堆填而成。堆土中含有大量陶器、石器和动植物残骸，并伴出土偶（陶塑）、陶耳饰、琥珀、黑曜石、翡翠之类的玉器等祭祀用器。翡翠中有不少翡翠原石和半成品，成品以翡翠珠居多，最大的一枚重达460克，这些翡翠原产地多为新潟县姬川，而黑曜石中10～15厘米长的大型黑曜石制品则来自北海道，这种从远处获得贵重物的现象，也反映出该聚落殊高的地位。大土堆被认为是附近居址区堆填生活废弃物之所，并在填埋时举行某种弃埋仪式。

陶器主要属“圆筒系陶器群”，其中，绳纹时代前期中、后叶的为“圆筒下层式”，中期的为“圆筒上层式”，均是这一时段东北地区北部至北海道西南部的典型陶器。遗址中还出有绳纹时代前期的漆器和天然沥青。