与普通电动机不同之处在于电机的密封性。前、后端盖与外壳的结合面之间，接线端口与接线端的结合面之间，紧固螺栓与螺栓孔的结合面之间设有静密封机构。电机轴与轴孔之间的密封机构是最难解决的问题之一，因为电机轴只要旋转，轴与机壳处就会有间隙。如果仍然采取在轴与机壳间加“O”型密封圈的方法，当电机高速旋转时，会导致“O”型密封圈的磨损、发热乃至变形，在较高的水压下就容易漏水。普遍采用动密封与静密封相结合的方式，并采用特殊的密封结构。

等级一般采用国际电工委员会（IEC）推荐的IP××等级标准，不同的安装场所，等级不同。在等级标准中，“××”是两位数字，第二位表示对液体的防护等级。液体防护等级有9个，分别用0～8表示。0：没有保护；1：水滴滴入外壳无影响；2：当外壳倾斜到15°时，水滴滴入外壳无影响；3：水或雨水从60°角落到外壳上无影响；4：液体由任何方向泼到外壳没有伤害影响；5：用水冲洗无任何伤害；6：可用于船舱内的环境；7：可于短时间内耐浸水（米）；8：于一定压力下长时间浸水。

深水电动机是高档的防水型电动机，下潜深度越大，防水等级越高。其下潜的深度应根据电动机的密封技术定，电动机的密封性越好，下潜深度越大。安装在深水机器人中的防水电动机，能在6000米水深持续工作250小时。

常用作潜水电泵，或作为深水机器人的驱动电机。