“Aigarchaeota”中的前缀源于希腊语“aigi”,意为“黎明和曙光”。该类群尚无纯化的菌株。2011年,日本科学家布浦拓郎[注]等对菱刈(Hishikari)金矿320米深、70℃的地下热水菌席中的一个占优势的未培养菌株(Ca. Caldiarchaeum subterraneum)进行了基因组构建和分析,提出该菌代表了古菌域中的一个新分支,建议命名为曙古菌门。不过,曙古菌门在系统发育学上与奇古菌很接近,也可能是隶属于后者的一个纲。因此,曙古菌门的系统发育学地位尚待确定。曙古菌相关的16S rRNA基因序列广泛存在于陆地、海洋、深部地下的地热环境,并表现出丰富的系统发育学多样性。
对曙古菌的形态特征了解不多,不过已发现,有的曙古菌成员呈细丝状,直径约为0.5微米,长度可达20微米。曙古菌的代谢类型也不清楚,已有的证据提示,此类古菌好氧,属于化能有机营养型,有可能利用有机酸、氨基酸、糖、芳香族化合物等,但也有可能进行自养代谢。有趣的是,曙古菌似乎编码真核生物类型的泛素化修饰系统,这在原核生物中尚属首次发现。