整合前，用户不得不分别与若干个源系统发生交互。而整合后，用户只需要和新生成的单个整合系统相交互，就能获得被整合的多个数字信息源的信息。现代数字资源系统在体系架构上由界面层、数据层和功能层3个部分组成，数字资源整合可以在系统的这3个层次上加以实施。

在源系统的界面层上进行的整合。它将多个源系统的用户界面进行集中的展示，为用户提供统一的个性化的界面，实现多个源系统在用户界面上的共享和互操作。界面整合的典型技术是门户技术，即一个门户网站可以将参与整合的系统中被封装成Portlet（一种可以聚合到页面中的可插拔的网络组件）的组件嵌入本地页面，提供对其他系统的入口界面，用户可以像使用本地界面那样对远程系统进行操作。界面整合的主要技术是由JSR 168 （一种用于Portlet的开发规范标准，Java Specification Request 168）定义的Portlet技术以及由WSRP（供远程Portlet组件使用的Web服务，Web Service for Remote Portlets）定义的Portlet远程调用技术。

在数据层上进行的整合。在数据层次，不同的源系统都具有各自的数据组织方式，数据类型、数据格式之间会存在异构性。数据整合的目的是屏蔽这些数据源之间的异构性和差异性，消除不同数据源之间的数据结构、命名、语义等冲突，使得用户可以透明地利用各个源系统的数据资源。数据整合又包括实体化整合和虚拟化整合两种不同类型。

①实体化整合。是一种物理整合方式，它将各源系统的数据事先装载到最终的整合系统中，建立统一的目标模式，用户所有的操作都在整合系统中进行，实现了对数字资源的集中式管理和服务。例如美国的临床数据仓储系统（Clinical DataRepository; CDR）。②虚拟化整合。是一种逻辑整合方式，它不对被整合的数据进行实际的物理保存，相反，被整合的数据仍旧保存在各个源系统本地，源系统保持自治。虚拟化整合可以将数字资源的元数据收割起来，形成数字资源指引库，从而实现源系统数据的共享，例如开放文献元数据收割协议（Open Archives Initiative Protocol for Metadata Harvesting; OAIPMH）的资源整合；也可以按某种协调机制分别从不同的数据源中取回相应的数据，经过去重、排序等以统一的格式展现给用户，例如基于超文本传输协议（Hyper Text Transfer Protocol; HTTP）表单的跨库检索系统。

在源系统的功能层上进行的整合。是指不同系统之间通过调用对方系统功能从而形成新的服务组合，以实现对对方系统资源的集成利用。功能整合是对源系统功能进行重组，使得分布式事务、过程在功能层面上实现交互，做到功能的共享与互操作，从而实现新的功能或者是对现有功能进行扩充。

一般情况下，被整合的功能之间通常具有两种关系：①互补关系。每个功能相对独立，但将它们整合到一起可以完成更复杂、要求更高的任务。②顺承关系。某一功能的完成是另一功能开始的前提，它们共同构成了一个完整的工作流程。功能整合的典型技术是Web Services（网络服务）。