通过综合性立法或专门立法保护农业环境是世界各国的通常做法。如瑞典1999年制定了《农业环境保护法》。欧盟国家借鉴了这一法律与其他环境政策法规，推出了相关立法保护农业环境。在中国，农业环境保护法于20世纪90年代被列入国家立法规划，但这部专门性法律仍未出台。有关农业环境保护的法律规定和相关制度措施，体现在环境保护和农业等相关法律法规之中，包括《中华人民共和国农业法》《中华人民共和国农业技术推广法》《中华人民共和国种子法》《中华人民共和国农产品质量安全法》《农业转基因生物安全管理条例》《农药管理条例》等。

《中华人民共和国农业法》（2012）设专章对农业环境资源的保护作了具体规定，其主要内容包括：①发展农业和农村经济必须合理利用和保护土地、水、森林、草原、野生动植物等自然资源，合理开发和利用水能、沼气、太阳能、风能等可再生能源和清洁能源，发展生态农业，保护和改善生态环境；加强林业生态建设，实施天然林保护、退耕还林工程；加强草原保护和建设；渔业生产应当保护和合理利用渔业资源。②保养耕地，合理使用化肥、农药、农用薄膜，增加使用有机肥料，采用先进技术，保护和提高地力，防止农用地的污染、破坏和地力衰退。③防治水土流失和土地沙化，保护森林、草原、湿地和渔业环境。④合理施肥和综合利用农业生产废弃物资的措施。⑤国家建立与农业生产有关的生物物种资源保护制度，保护生物多样性，对稀有、濒危、珍贵生物资源及其原生地实行重点保护。⑥县级以上人民政府应当采取措施，督促有关单位进行治理，防治废水、废气和固体废弃物对农业生态环境的污染。⑦除上述措施制度外，还规定了农产品质量标准和质量检验检测监督制度、优质农产品认证和标志制度、动植物防疫检疫制度、农业资源环境监测制度等。